한타바이러스는 한국 전쟁 중에 처음 발견되었다. 전쟁 당시 HFRS는 한탄강 인근에 주둔한 군인들 사이에서 흔한 질병이었다. 최초의 한타바이러스는 1978년 대한민국에서 분리되었으며, 한탄 바이러스(Hantaan virus)로 명명되었다. 이 바이러스가 전쟁 중의 발병 원인임이 밝혀졌다. 몇 년 이내에 HFRS를 일으키는 다른 한타바이러스들이 유라시아 전역에서 발견되었다. 1982년에 세계보건기구(WHO)는 이 질환에 HFRS라는 이름을 부여했고, 1987년에 한타바이러스는 처음으로 독립된 속으로 분류되었다. 이들은 집합적으로 한탄 바이러스와 한탄강의 이름을 따서 명명되었다.

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